בימי הביניים עלתה קרנה של האנטומיה באופן הדרגתי. האפיפיור באותם הימים אסר נתיחת גופות בדרך כלל.  הותרה נתיחת גופות של עבריינים עליהם נגזר גזר דין

במאה השלוש עשרי דעכה קרנה של Montpellier כמרכז הרפואי היוקרתי ביותר באירופה ומקומה נתפש על ידי פריז ופדואה.  בין הרופאים שהעלו את קרנה של אוניברסיטת

כבר הערנו מספר פעמים כי ימי הביניים לא הוסיפו תרומות אוריגינליות למקצוע הרפואה וכאשר נסיים את  הסיפור על בית הספר לרפואה בסלרנו נעבור ישר למאה