בפעם הראשונה זיהו חוקרים עדות לזיהום פעיל וממושך בנגיף קורונה במערכת העיכול של חולים מאומתים עם COVID-19. בדיקות צואה היו חיוביות בקרב חולים ללא תסמינים במערכת העיכול, כאשר בחלק מהמקרים אלו נותרו חיוביות עד 6 ימים לאחר תוצאה שלילית לנגיף בדגימה מחלל האף והלוע.
ברקע למחקר מסבירים החוקרים כי למרות שרנ”א של נגיף הקורונה זוהה בדגימות צואה מחולים עם COVID-19, דרגת הפעילות וההדבקה של הנגיף במערכת העיכול אינם מובנים היטב. כעת הם ביקשו לבחון את פעילות השעתוק של נגיף הקורונה והקשר עם שינויים במיקרוביום של חולים עם COVID-19.
החוקרים ערכו בדיקות רנ”א בסדרה של דגימות צואה מ-15 חולים מאושפזים עם COVID-19 וכימתו את הגנום של נגיף הקורונה. מטרת המחקר הייתה לבחון את הרכב המיקרוביום בצואה והפונקציונאליות של המיקרוביום בהתאם לחותמות נגיף קורונה מדבק בצואה.
מהנתונים עולה כי ב-7 מבין 15 חולים (46.7%) עם COVID-19 התקבלה תוצאת דגימת צואה חיובית לנגיף קורונה. גם בהעדר ביטויים במערכת העיכול, בכל שבעת החולים תועד כיסוי וצפיפות גבוהים יותר של קצה 3′ ו-5′ של גנום הנגיף בצואה.
בשלושה חולים עדיין הייתה עדות לחותמת זיהום פעיל בצואה עד 6 ימים לאחר קבלת תוצאה שלילית בדגימה מחלל האף והלוע לנגיף הקורונה.
בדגימות צואה עם חותמת המעידה על רמת הדבקה גבוהה של נגיף הקורונה תועדה שכיחות גבוהה יותר של זני Collinsella aerofaciens, Collinsella tanakaei, Streptococcus infantis, Morganella morganii ויכולת תפקודית גבוהה יותר לייצור נוקליאוטידים דה-נובו, ייצור חומצות אמינו וגליקוליזה, בעוד שבדגימות צואה עם חותמת של נגיף קורונה עם יכולת הדבקה מעטה, אם בכלל, תועדה שכיחות גבוהה יותר של חיידקים המייצרים חומצות שומן קצרות-שרשרת, Parabacteroides merdae, Bacteroides stercoris, Alistipes onderdonkii ו-Lachnospiraceae bacterium 1_1_57FAA.
מחקר הפיילוט הנוכחי מספק עדות לנוכחות נגיף קורונה פעיל ולאורך פרק זמן ממושך במערכת העיכול של נבדקים שהחלימו מ-COVID-19, גם בהעדר ביטויים במערכת העיכול של הזיהום הנגיפי.
Gut. Published online July 20 2020
תגובות רוצה להצטרף לדיון?
יש להתחבר כדי להגיב.
התחבראין תגובות עדיין. היה הראשון להגיב!